Chùa Bảo Lâm tọa lạc tại thôn Liên Trì, xã Bình Kiến, Tp Tuy Hòa, tỉnh Phú Yên, hướng về phía Đông núi Chóp Chài, diện tích 4ha, Chùa do Tổ Phái Lâm Tế đời thứ 38 húy Đạo Trung sáng lập vào thời vua Minh Mạng.
Chùa Bảo Lâm - Phú Yên
Trước năm 1945, Chùa thành lập Bảo Lâm Phật Học Hội, nơi đây đào tạo khá đông đệ tử các chùa trong tỉnh về học. Năm 1945, địa phương mượn Chánh điện làm trụ sở cơ quan; nhà Đông, nhà Tây làm trường Mẫu Giáo. Bảo Lâm Phật Học Hội giải tán, tất cả pháp bảo của chùa phải gửi về chùa Khánh Sơn. Năm 1949, một cơn bảo lớn đã xô sập hoàn toàn ngôi chùa, những vật liệu kiến trúc hầu như bị hư nát và thất lạc hết, không còn lưu lại được gì , sau đó chùa được phục hồi trong hoàn cảnh khánh chiến vào khoảng thời gian 1946 – 1954, nhưng không được bao lâu thì bị Pháp đô hộ chống phá, một lần nữa Chùa lại bị thiểu hủy điêu tàn. Hòa thượng trụ trì lúc bấy giờ cùng tăng chúng phải tạm trú trong một am tranh nhỏ cách đó không xa.
Chính điện chùa Bảo Lâm
Năm 1956, Chùa được phục hồi lại tại một địa điểm mới thuộc Thôn Liên Trì – Xã Bình Kiến, cách địa điểm cũ khoảng 500m. Nơi đó có hồ sen nên hiệu của chùa đặt lại là Chùa Bửu Liên.
Năm 1974, sau khi Hòa thượng trụ trì viên tịch, đệ tử kế thừa là Tỳ kheo Thích Nguyên Từ dời chùa về địa điểm cũ. Xây dựng lại ngôi Chánh điện trong khuông viên điêu tàn của chiến tranh.
Năm 1999, Chùa xây dựng tượng Thích Ca Phật Đài, cao 18m về hướng Nam, cách Chánh điện khoảng 50m
Năm 2004, Chùa khởi công xây dựng tháp chuông cao 12m đồng thời tiến hành đúc Đại Hồng Chung (chuông), nặng 1,5 tấn
Năm 2006, Chùa được đại trùng tu, chánh điện được xây dựng theo kiến trúc cổ lầu, có diện tích 240 m2, chiều cao 17m, nhằm đáp ứng nhu cầu lễ bái Phật tử gần, xa.
Chính diện chùa Bảo Lâm
Điện Di Lặc được xây dựng vào năm 2000